临床太忙,没有时间做实验,怎么发SCI?
【医药加】项目合作 | ||
研究方向 | 解决问题 | 分析内容 |
非编码RNA_circRNA及lncRNA相关 | 1. 如果有目标基因,那么我们可以协助进行分析,得到逻辑的创新的基因与疾病关联依据。提供国自然前期研究基础的理论依据。 2. 如果没有靶标基因,那么我们可以协助进行数据挖掘,筛选关键靶标基因与靶标通路。提供国自然前期研究基础的理论依据。 | 数据来源:(1)基于自己样本的测序数据、芯片数据或质谱数据等高通量数据进行生信高级挖掘; (2) 基于公共数据库(TCGA, GEO, ICGC, CGGA, SRA等)的高通量数据进行生信高级挖掘; 分析内容:(1) 基于客户提供目标基因与疾病,进行单基因生信分析,提供该基因与疾病的逻辑关联依据。 (2)基于高通量数据进行生信挖掘,获得结论,为客户提供关键靶标基因或靶标通路目标。 |
ceRNA相关 | ||
m6A RNA甲基化相关 | ||
单细胞相关 | ||
外泌体囊泡相关 | ||
多组学相关 | ||
铁死亡相关 | ||
自噬、焦亡、坏死相关 | ||
肠道菌群相关 | ||
癌症靶标相关 | ||
网络药理学相关 |
可扫码详细咨询医药加宋老师团队
个人成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉、成都等城市举办过几十场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《TCGA/GEO数据库挖掘分析》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》、《ceRNA网络构建分析》等。
医药加平台推出生信高级分析服务 (由医药加生信班专家讲师-宋伟博士团队提供服务)
生物信息是一种综合性的学科,也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系,通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容。
我们需要“强强联合”,把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务,可以节省时间、提高质量。
高级分析特点:不同项目方向做高级生信分析,设计不同的创新思路,达到课题研究目的,获得结果(图表)及结论。
定制化数据分析内容展示:
【医药加】多组学数据整合挖掘与分析研讨会
2021年12月17-19日 腾讯会议网络会议室
【背景介绍】
2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目,批助金额总计441310万元。这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中,与通路(pathway)关联的有1349项,金额4.89亿;与miRNA相关的有630项,金额2.3亿;与lncRNA相关的有395项,金额1.45亿,与甲基化相关的有213项,金额8748万,与突变相关的有190项,金额7410万;
如何获得有创新意义的疾病靶标基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是项目申请及文章写作时最常见的问题。
目前,多组学整合分析是一个非常热门且创新的方向。通过多组学整合分析我们可以更加快速、准确的找到与研究方向关联的biomarks。它的核心原理是期望通过高通量数据,找到所有基因在不同组学水平中的变化并进行分析,获得关键基因在各个组学都有显著作用。
多组学整合分析的原始数据来源有两种:(1)自己采集样本做高通量测序/芯片/质谱等;(2)使用公共数据库中的组学数据(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。
【主要内容】详细内容见下文日程表
多组学分析常用数据库;
多组学分析常用软件和工具;
教授对应的图片制作方法(包含但不限于聚类热图、火山图、富集分析图、Venn图、pathwaymap)
【会议预期】
通过三天的学习,了解多组学整合分析思路对项目及文章的帮助,以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。
【讲师简介】
宋伟博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。
主办方:上海遐永医药科技有限公司
会议时间:2021年12月17-19日
会议地点:
线上:腾讯会议网络会议室
收费标准:会务费:3200元/人
优惠政策:
1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2.三人组团报名,每人优惠100元
3.四人组团报名,每人优惠200元,
4.六人组团报名缴费,可免1人会务费!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:必须携带win10以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。
交费方式:
请咨询报名老师
【会议日程】
通过本次研讨会,您将学会以下作图:
示例图 网络图
示例图 pathway map图
示例图 关键基因的KM生存曲线图
示例图 相关性散点图